追跡が難しいがんに、ようやくより明確な分子シグナルが見えてきた可能性がある

テキサス大学MDアンダーソンがんセンターとテキサス大学オースティン校の研究者らは、炎症性乳がん、すなわちIBCを他の乳がんサブタイプと区別する血液ベースのゲノムバイオマーカーを特定した。この研究はScience Advancesに掲載され、最も攻撃性の高い乳がんの一つに対して、診断、疾患モニタリング、治療開発へのより低侵襲な道筋を示す可能性がある。

IBCは、異常に致死率が高く、しかも解析がきわめて難しいため、臨床医や研究者を長く悩ませてきた。標準的なゲノムシーケンシング手法では、がん関連遺伝子変異のレベルで非炎症性乳がんと区別することが難しかった。そのため、特に腫瘍サンプルの入手が難しい場合に、より良い診断法や標的治療を開発する取り組みが制限されてきた。

今回の研究は別のアプローチを取っている。重要なRNAシグナルを見落とす可能性のある従来のシーケンシング法に頼るのではなく、研究者らはTGIRTシーケンシングと呼ばれる手法を用いて、血液サンプルに含まれるRNAをより広く捉えた。

炎症性乳がんの研究がこれほど難しい理由

原文はIBCを、最も致死的で攻撃的な乳がんのタイプとして説明している。それにもかかわらず、その重篤さにもかかわらず、分子レベルでは他の乳がんと区別するのが難しいままだった。その背景には技術的な制約がある。標準的なRNAシーケンシング法では、複雑で断片化した、あるいは扱いにくいRNA分子をうまく処理できない酵素が使われており、潜在的に有用な情報が見えないままになっている。

RNAは生体内で実際に進行している生物学的プロセスを反映するため、これは重要だ。もし特定のRNAパターンがIBCと非IBC疾患の間で一貫して異なるなら、それらはがんを分類し、時間とともにどう変化するかを追跡する実用的な方法になり得る。そうしたパターンを見逃すことは、この病気がなぜこれほど攻撃的に振る舞うのかを説明しうる生物学の一部を見逃すことでもある。

TGIRTシーケンシングが加えるもの

TGIRTシーケンシングは、厳しい条件下でも複雑で断片化したRNAを扱える、より強力な酵素を用いる。提供された原文によると、これにより研究者らはサンプル中に存在するあらゆる種類と量のRNAを、より包括的に捉えられる。今回はサンプルが血液であるため、この手法は液体生検への応用に特に魅力的だ。

患者にとって、その利点は明らかだ。血液ベースの検査は、腫瘍の繰り返し採取よりも低侵襲で、時間を追って反復しやすく、病勢のモニタリングにも実用的である。研究者にとっては、標準手法では何度も見逃されてきた差異を明らかにしうる、より豊かなデータセットが得られる。

MDアンダーソンの主任研究者サヴィトリ・クリシュナムールティ氏は、この結果により、臨床医が液体生検だけで病勢進行をモニタリングできるようになるはずだと述べた。また、この患者集団では腫瘍サンプルの入手が難しいため、血液ベースのバイオマーカーは治療開発に変革的な影響を与えうるとも指摘した。