ஒரு நிரூபிக்கப்பட்ட யோசனை ஒரு மைல்கல்லை அடைகிறது

நவீன மருந்து கண்டுபிடிப்பு நீண்ட காலமாக எளிய உவமைகளால் ஆதிக்கம் செலுத்தி வருகிறது. ஒரு ரிசெப்டர் என்பது ஒரு பூட்டு, ஒரு லைகண்ட் என்பது ஒரு சாவி, மேலும் ஒரு நோயை ஒன்றைத் திறக்காமல் தடுத்து சிகிச்சையளிக்க முடியும். நடைமுறையில், இதனால் பயனுள்ள மருந்துகளின் ஒரு தலைமுறை உருவாகியுள்ளது; ஆனால் அதே நேரத்தில் முழு புரதக் குடும்பங்கள் அணுக முடியாத நிலையில் இருந்துள்ளன. நோயுடன் தொடர்புடைய பல புரதங்களுக்கு தெளிவாக வரையறுக்கப்பட்ட பாக்கெட் இல்லை, தெளிவான செயல் இடம் இல்லை, மேலும் பாரம்பரிய தடுப்பியைப் பயன்படுத்தி அவற்றை அமைதியாக்கும் வெளிப்படையான வழியும் இல்லை.

அதிகரித்து வரும் எண்ணிக்கையிலான ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு, தீர்வு தனிப்பட்ட புரதங்களைப் பற்றிச் சிந்திப்பதை நிறுத்தி, அவற்றுக்கிடையிலான இடைவெளியைப் பற்றி சிந்திக்கத் தொடங்குவதே. செல்கள் புரதங்களை ஒன்றுக்கொன்று நெருக்கமாகக் கொண்டு வந்து தங்களின் நடத்தையை முறையாகக் கட்டுப்படுத்துகின்றன. கினேஸ்கள் தங்களின் சப்ஸ்ட்ரேட்டுகளைச் சந்திக்கின்றன, E3 லைகேஸ்கள் தங்களின் இலக்குகளைச் சந்திக்கின்றன, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஃபாக்டர்கள் தங்களின் கோஆக்டிவேட்டர்களைச் சந்திக்கின்றன. ஒரு மருந்து எந்தப் புரதங்கள் ஒன்றுடன் ஒன்று தொடர்பு கொள்ள வேண்டும் என்பதை நிர்ணயிக்க முடிந்தால், அது சிகிச்சைச் செய்தியை நிறைவேற்ற செலின் சொந்த ஒழுங்குபடுத்தும் இயந்திரத்தைப் பயன்படுத்த முடியும். தூண்டப்பட்ட-அருகாமை எனப்படும் அந்த யோசனைக்கு, மார்பக புற்றுநோய்க்கு முதல் அங்கீகரிக்கப்பட்ட PROTAC இப்போது தீர்மானமான மருத்துவ நம்பிக்கை வழங்கியுள்ளது.

PROTACs: அருகாமையையே வேலை செய்ய வைப்பது

PROTAC—proteolysis-targeting chimera என்பதன் சுருக்கம்—இரு முனைகளும் ஒரு linker மூலம் இணைக்கப்பட்ட ஒரு இரட்டை-செயல்பாட்டு மூலக்கூறு. ஒரு முனை குறிப்பிட்ட இலக்கு புரதத்துடன் பிணையும்படி வடிவமைக்கப்படுகிறது. மற்ற முனை E3 ubiquitin ligase-ஐ ஆட்சேர்ப்புச் செய்கிறது; இது பொதுவாக புரதங்களை அழிவிற்காக குறிச்சொல் இடும் ஒரு என்சைம். இரு முனைகளும் பிணைக்கப்பட்டு, இரண்டு புரதங்களும் ஒன்றுக்கொன்று நெருக்கமாக இழுக்கப்படும்போது, அந்த ligase இலக்கு புரதத்தில் ubiquitin சங்கிலிகளைச் சேர்க்கத் தொடங்குகிறது. ubiquitinated புரதத்தை பெரிய protease தொகுதியாகிய proteasome அடையாளம் கண்டு, அதை சிதைக்கிறது.

PROTAC புரதங்களை ஒன்றுக்கொன்று அருகில் கொண்டு வருவதால், அதன் விளைவு stoichiometric அல்ல, catalytic ஆகும். ஒரே ஒரு மூலக்கூறு பல சிதைவு சுற்றுகளை வழிநடத்த முடியும். இந்த வடிவமைப்பு, இலக்கு புரதம் ஒரு என்சைமாக இருக்க வேண்டிய அவசியமில்லை என்பதையும், அதைத் தடுப்பதற்கான ஆழமான druggable site தேவையில்லை என்பதையும் குறிக்கிறது. அது சில சிறு-மூலக்கூறு துண்டுகளால் பிணைக்கப்படக்கூடியதாக இருந்தால் போதும்—மேலும் பல மருந்தாக்க முடியாத புரதங்களில் பிணைப்பை ஆதரிக்கக்கூடிய surface pockets அல்லது மென்மையான பள்ளங்கள் உள்ளன.

கடந்த இருபது ஆண்டுகளில், PROTACs மூலக்கூறு ஆச்சரியங்களிலிருந்து செம்மைப்படுத்தப்பட்ட சோதனைச் சிகிச்சைகளாக வளர்ந்தன. வேதியியலாளர்கள் அவற்றின் permeability, metabolic stability, selectivity, மற்றும் tissue-relevant ligases-க்கு specificity ஆகியவற்றை மேம்படுத்தினர். Translational ஆராய்ச்சியாளர்கள் உயிர்நிலையில் சிதைவை எவ்வாறு அளவிடுவது, pharmacodynamic பதில்களை எவ்வாறு கண்காணிப்பது என்பதை கற்றுக்கொண்டனர். ஆனால் சமீப காலம் வரை, இந்தத் துறையில் மிகப் பயனுள்ள ஒரு உறுதிப்படுத்தல் இல்லை: ஒரு பெரிய நோய்க்கான சிகிச்சையாக PROTAC-க்கு கிடைக்கும் ஒழுங்குமுறை ஒப்புதல்.

மார்பக புற்றுநோய் ஒப்புதலும் அதன் அர்த்தமும்

அதனால் மார்பக புற்றுநோயில் PROTAC-க்கு கிடைத்த ஒழுங்குமுறை பசுமை விளக்கு, இன்னொரு புதிய oncology மருந்தை விட பல மடங்கு முக்கியமானது. இது ஒரு செயன்முறைக்கு பொதுமக்கள், ஒழுங்குமுறை, மற்றும் வணிக ரீதியான உறுதிப்படுத்தலாகும்; அது ஆய்வகத்திற்கு வெளியே இயங்குவதற்கு மிகுந்த புத்திசாலித்தனமாக உள்ளது என்று ஒருகாலத்தில் பல சந்தேகப்படுவோர் கருதியிருந்தனர். இந்த ஒப்புதல், ஒரு solid tumor குறியீட்டிற்காக ஒழுங்குமுறை ஆதரவைப் பெறும் அளவுக்கு பாதுகாப்பாக ஒரு induced-proximity மருந்தை வடிவமைக்கவும், வழங்கவும், நிர்வகிக்கவும் முடியும் என்பதை காட்டுகிறது.

அந்த நிரூபணத்திற்காக மார்பக புற்றுநோய் குறிப்பாக முக்கியமான சூழல். பல மார்பகப் புற்றுநோய்கள் steroid hormone receptors மூலம் இயக்கப்படுகின்றன; அவை tumor cell வளர்ச்சியை ஒழுங்குபடுத்துகின்றன. Endocrine therapy-க்கு எதிர்ப்பு பெரும்பாலும் receptor activity-யை மாற்றும் mutations மூலமாகவோ, அல்லது receptor-ஐ சிதைவிலிருந்து பாதுகாக்கும் splice isoforms மூலமாகவோ தோன்றுகிறது. Receptor-ஐ அழிவிற்காக குறிச்சொல் இடும் ஒரு PROTAC, ligand-binding site-ஐ வெறும் occupy செய்வதற்குப் பதிலாக, முழு protein-ஐயே அகற்ற முடியும்; எனவே அது பல resistance mechanisms-ஐ கடந்து செல்லக்கூடும்.

அப்படியிருந்தாலும், இதன் முக்கியத்துவம் மார்பகப் புற்றுநோயைக் கடந்து வெகுவாக விரிகிறது. இந்த வெற்றிகரமான ஒப்புதல், மற்ற induced-proximity திட்டங்களுக்கான ஆபத்து மதிப்பீட்டை அடிப்படையாக மீட்டமைக்கிறது. molecular glues, PROTACs, மற்றும் தொடர்புடைய மூலக்கூறுகளை ஆண்டுகள் பல உருவாக்கி வந்த sponsors மற்றும் academic investigators இப்போது ஒரு தெளிவான முன்னுதாரணத்தைச் சுட்டிக்காட்ட முடியும்—புரதங்களை ஒன்றாகக் கொண்டு வந்து செயல்படும், மேலும் ஒழுங்குமுறை அறிவியலின் எல்லா தடைகளையும் கடந்து வந்த ஒரு மூலக்கூறு.

விரிவடைந்து வரும் proximity கருவிப்பெட்டி

Induced proximity என்ற சொல் புரத சிதைவைக் காட்டிலும் அதிகத்தைக் குறிக்கிறது. அதே இடவியல் கட்டுப்பாட்டை மற்ற post-translational நிகழ்வுகளை ஊக்குவிக்கவும் பயன்படுத்தலாம். குறிப்பிட்ட phosphorylation நிகழ்வு நடைபெற ஒரு kinase-ஐ ஒரு substrate-க்கு அருகில் கொண்டு வரும் சேர்மங்களை ஆராய்ச்சியாளர்கள் வடிவமைக்கிறார்கள்; மற்றவர்கள் ubiquitin-ஐ அகற்றி ஒரு புரதத்தை நிலைப்படுத்த ஒரு deubiquitinase-ஐ ஆட்சேர்ப்புச் செய்யும் மூலக்கூறுகளை உருவாக்குகிறார்கள். proximity-enabled activators-லும் உள்ளன; இதில் ஒரு புரதம் அதைச் செயல்படுத்தும் ஒரு என்சைமிடம் கொண்டு வரப்படுகிறது, மேலும் proximity-enabled inhibitors-லும் உள்ளன; அவை ஒரு என்சைமைக் பொதுவாக அது எட்ட முடியாத இலக்கை நோக்கி திருப்புகின்றன.

இது சாத்தியமான இலக்குகளின் மற்றும் சிகிச்சை முறைகளின் பரப்பை விரிவாக்குகிறது. ஒரு நோய், தீங்கான புரதத்தை நீக்குவதைக் காட்டிலும் பாதுகாப்பான புரதத்தின் அளவை அதிகரிப்பதன் மூலம் சிறப்பாக சிகிச்சையளிக்கப்படலாம். அல்லது ஒரு புரதத்தின் post-translational நிலையை மாற்றி, அதன் போக்குவரத்து, signaling, அல்லது துணைகளுடன் உள்ள தொடர்பை மாற்றி நோயைச் சிகிச்சையளிக்க முடியும். PROTAC-ன் மையத்தில் உள்ள அதே modular architecture, அந்த நோக்கங்களுக்குப் பொருந்துமாறு மாற்றிக் கொள்ளலாம்; ஒரு effector domain-ஐ மற்றொன்றால் மாற்றலாம்.

முதல் ஒப்புதலுக்குப் பிறகு என்ன வருகிறது

இப்போது ஒரு proof point கிடைத்துள்ளதால், இந்தத் துறை ஒரு பரிச்சயமான சவாலைக் காண்கிறது: முதல் வெற்றியை நீடித்த platform ஆக மாற்றுவது. தொழில்துறை வேதியியல் குழுக்கள் warheads, linkers, மற்றும் ligase ligands ஆகியவற்றின் நூலகங்களை விரிவுபடுத்தும் முயற்சிகளை வேகப்படுத்தும் என எதிர்பார்க்கப்படுகிறது. இந்த ஒப்பீட்டளவில் பெரிய மூலக்கூறுகளுக்கான oral bioavailability மற்றும் tissue exposure-ஐ மேம்படுத்துவது இன்னும் கடினமாகவே உள்ளது; மேலும் ஒவ்வொரு புதிய இலக்கும் சரியான திசுவில் போதுமான அளவில் வெளிப்படும் ligase-உடன் கவனமாக பொருத்தப்பட வேண்டும்.

இருப்பினும், இந்த ஒப்புதல் companion diagnostics மற்றும் biomarkers வளர்ச்சிக்கும் ஊக்கமளிக்கிறது; அவை தங்கள் கட்டிகள் இலக்கு புரதத்தின் மீது அதிகமாக சார்ந்திருக்கும் நோயாளிகளை அடையாளம் காண உதவும். இது degraders-க்கு உருவாகும் acquired resistance பற்றிய தெளிவான ஆய்வுகளையும் சாத்தியமாக்குகிறது; அதன் விளைவாக second-generation agents வடிவமைப்பும் முன்னேறும். மேலும் பாரம்பரிய inhibitors மிதமான செயல்திறன் மட்டுமே காட்டிய clinical settings-இல் induced-proximity drugs-ஐ பரவலாக சோதிக்க ஒரு தூண்டுதலையும் உருவாக்குகிறது.

ஒரு மருத்துவத் திருப்புமுனை

மார்பக புற்றுநோய்க்கு முதல் அங்கீகரிக்கப்பட்ட PROTAC கதை முடிவல்ல; ஒரு புதிய அத்தியாயத்தின் தொடக்கமே. ஒரு மருந்து புரதங்களை ஒன்றுக்கொன்று நெருக்கமாகக் கொண்டு வந்து செயல்பட முடியும் என்பதை காட்டுவதன் மூலம், இது செல்பாகுபாட்டியலின் ஆழமான கோட்பாட்டை உறுதிப்படுத்துகிறது: அருகாமை என்பது செல்களின் கட்டுப்பாட்டின் பழமையானதும் பரவலானதும் ஒரு வடிவம். மேலும் ஆராய்ச்சியாளர்கள் அந்தக் கோட்பாட்டை இயக்கக் கற்றுக்கொள்ளும்போது, மருந்தாக்கக்கூடிய இலக்குகளின் தொகுப்பு, கடந்த நூற்றாண்டின் மருந்து மேம்பாட்டில் ஆதிக்கம் செலுத்திய பாரம்பரிய pockets மற்றும் active sites-ஐ விட மிகவெகுதூரம் விரியும்.

இந்த செய்தியுடன் வந்த Nature Medicine கட்டுரை இந்த மாற்றத்தை சுருக்கமாகப் பிடித்துக் காட்டுகிறது. ஒருகாலத்தில் ஆய்வக ஆச்சரியமாக இருந்த induced proximity, இப்போது முதிர்ச்சி அடைந்துள்ளது. முதல் degrader யோசனையிலிருந்து அங்கீகரிக்கப்பட்ட சிகிச்சை வரை சென்ற பாதை நீளமானது; ஆனால் அது எதிர்கால மருந்துகள்—புற்றுநோய்க்கும் அதற்குப் பிற்கும்—அதிக நம்பிக்கையுடன் பின்பற்றக்கூடிய ஒரு வழியைக் திறந்துள்ளது.

இந்தக் கட்டுரை Nature Medicine-இன் செய்திப்பதிப்பை அடிப்படையாகக் கொண்டது. மூலக் கட்டுரையைப் படிக்கவும்.

Originally published on nature.com